雖然本案引發高度關注，但相關討論多集中在責任追究部分，鮮少觸及本案對今後國家安全，尤其是我國與其他國家的戰略合作，所可能造成的嚴重影響；對相關損害管制、亡羊補牢與災後重建等，比究責更重要的議題，也沒有太多著墨。

掌握行程，形同握有與我國進行敏感性交流的對象索引，讓中共可鎖定應重點監控的對象，並研判這些非邦交國與我方可能的合作內容，並以此為依據加強情蒐作為，或規劃相應的對抗措施。更嚴重的是，在事件曝光後，過去8年曾與吳釗燮先生碰面的非邦交國人士，如今恐怕人人自危。

對美方而言，光是強調嫌疑人只負責行程，不足以說服美方放心。因為美方一定會懷疑，如果我們連最基本的查核都漏洞百出，則其他包括機密文件與資訊的保密，也非常可能存在嚴重缺失，或在執行上未能落實。

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